Klasifikasi virus

Klasifikasi Baltimore berdasarkan metode sintesis mRNA virus

Klasifikasi virus adalah proses pemberian nama dan pengelompokan virus berdasarkan karakteristik yang dimilikinya. Ada beberapa cara mengelompokkan virus, misalnya berdasarkan karakteristik fenotipe, seperti morfologi, jenis asam nukleat, cara replikasi, organisme inang, serta jenis penyakit yang mereka timbulkan. Secara formal, klasifikasi taksonomi virus merupakan wewenang dan tanggung jawab Komite Internasional Taksonomi Virus (ICTV). Meskipun demikian, sistem klasifikasi Baltimore juga sering digunakan untuk memudahkan pengelompokan virus. Sistem ini membagi virus menjadi tujuh grup berdasarkan cara mereka menyintesis mRNA. Konvensi pemberian nama yang spesifik dan pedoman untuk klasifikasi lebih lanjut ditetapkan oleh ICTV.

Klasifikasi ICTV

Seperti taksonomi makhluk hidup pada umumnya, klasifikasi virus juga dilakukan secara hierarkis atau bertingkat. Sistem klasifikasi virus yang diusulkan oleh ICTV saat ini yaitu:^[1]

Dunia (-viria)

Subdunia (-vira)

Kerajaan (-viriae)

Subkerajaan (-virites)

Filum (-viricota)

Subfilum (-viricotina)

Kelas (-viricetes)

Subkelas (-viricetidae)

Ordo (-virales)

Subordo (-virineae)

Famili (-viridae)

Subfamili (-virinae)

Genus (-virus)

Subgenus (-virus)

Spesies

Dalam klasifikasi virus, terdapat banyak takson yang dikategorikan sebagai incertae sedis atau penempatannya tidak pasti. Pada tahun 2019, 4 dunia, 9 kerajaan, 16 filum, 2 subfilum, 36 kelas, 55 ordo, 8 subordo, 168 famili, 103 subfamili, 1.421 genus, 68 subgenus, dan 6.589 spesies virus telah ditetapkan oleh ICTV.^[2] Klasifikasi virus hingga ke tingkat famili dapat dilihat pada tabel di bawah ini.

Taksonomi virus hingga tingkat famili (ICTV, 2019)
Dunia	Kerajaan	Filum	Kelas	Ordo	Famili
Duplodnaviria	Heunggongvirae	Peploviricota	Herviviricetes	Herpesvirales	Alloherpesviridae, Herpesviridae, Malacoherpesviridae
Duplodnaviria	Heunggongvirae	Uroviricota	Caudoviricetes	Caudovirales	Ackermannviridae, Autographiviridae, Chaseviridae, Demerecviridae, Drexlerviridae, Herelleviridae, Myoviridae, Podoviridae, Siphoviridae
Monodnaviria	Loebvirae	Hofneiviricota	Faserviricetes	Tubulavirales	Inoviridae, Plectroviridae
	Sangervirae	Phixviricota	Malgrandaviricetes	Petitvirales	Microviridae
	Shotokuvirae	Cossaviricota	Mouviricetes	Polivirales	Bidnaviridae
			Papovaviricetes	Sepolyvirales	Polyomaviridae
			Papovaviricetes	Zurhausenvirales	Papillomaviridae
			Quintoviricetes	Piccovirales	Parvoviridae
		Cressdnaviricota	Arfiviricetes	Baphyvirales	Bacilladnaviridae
				Cirlivirales	Circoviridae
				Cremevirales	Smacoviridae
				Mulpavirales	Nanoviridae
				Recrevirales	Redondoviridae
			Repensiviricetes	Geplafuvirales	Geminiviridae, Genomoviridae
	Trapavirae	Saleviricota	Huolimaviricetes	Haloruvirales	Pleolipoviridae
Riboviria	Orthornavirae	Duplornaviricota	Chrymotiviricetes	Ghabrivirales	Chrysoviridae, Megabirnaviridae, Quadriviridae, Totiviridae
			Resentoviricetes	Reovirales	Reoviridae
			Vidaverviricetes	Mindivirales	Cystoviridae
		Kitrinoviricota	Alsuviricetes	Hepelivirales	Alphatetraviridae, Benyviridae, Hepeviridae, Matonaviridae
				Martellivirales	Bromoviridae, Closteroviridae, Endornaviridae, Kitaviridae, Mayoviridae, Togaviridae, Virgaviridae
				Tymovirales	Alphaflexiviridae, Betaflexiviridae, Deltaflexiviridae, Gammaflexiviridae, Tymoviridae
			Flasuviricetes	Amarillovirales	Flaviviridae
			Magsaviricetes	Nodamuvirales	Nodaviridae, Sinhaliviridae
			Tolucaviricetes	Tolivirales	Carmotetraviridae, Luteoviridae, Tombusviridae
		Lenarviricota	Allassoviricetes	Levivirales	Leviviridae
			Amabiliviricetes	Wolframvirales	Narnaviridae
			Howeltoviricetes	Cryppavirales	Mitoviridae
			Miaviricetes	Ourlivirales	Botourmiaviridae
		Negarnaviricota	Chunqiuviricetes	Muvirales	Qinviridae
			Milneviricetes	Serpentovirales	Aspiviridae
			Monjiviricetes	Jingchuvirales	Chuviridae
			Monjiviricetes	Mononegavirales	Artoviridae, Bornaviridae, Filoviridae, Lispiviridae, Mymonaviridae, Nyamiviridae, Paramyxoviridae, Pneumoviridae, Rhabdoviridae, Sunviridae, Xinmoviridae
			Yunchangviricetes	Goujianvirales	Yueviridae
			Ellioviricetes	Bunyavirales	Arenaviridae, Cruliviridae, Fimoviridae, Hantaviridae, Leishbuviridae, Mypoviridae, Nairoviridae, Peribunyaviridae, Phasmaviridae, Phenuiviridae, Tospoviridae, Wupedeviridae
			Insthoviricetes	Articulavirales	Amnoonviridae, Orthomyxoviridae
		Pisuviricota	Duplopiviricetes	Durnavirales	Amalgaviridae, Hypoviridae, Partitiviridae, Picobirnaviridae
			Pisoniviricetes	Nidovirales	Abyssoviridae, Arteriviridae, Coronaviridae, Cremegaviridae, Euroniviridae, Gresnaviridae, Medioniviridae, Mesoniviridae, Mononiviridae, Nanghoshaviridae, Nanhypoviridae, Olifoviridae, Roniviridae, Tobaniviridae
				Picornavirales	Caliciviridae, Dicistroviridae, Iflaviridae, Marnaviridae, Picornaviridae, Polycipiviridae, Secoviridae, Solinviviridae
				Sobelivirales	Alvernaviridae, Barnaviridae, Solemoviridae
			Stelpaviricetes	Patatavirales	Potyviridae
			Stelpaviricetes	Stellavirales	Astroviridae
		Incertae sedis	Incertae sedis	Incertae sedis	Birnaviridae, Permutotetraviridae
	Pararnavirae	Artverviricota	Revtraviricetes	Blubervirales	Hepadnaviridae
	Pararnavirae	Artverviricota	Revtraviricetes	Ortervirales	Belpaoviridae, Caulimoviridae, Metaviridae, Pseudoviridae, Retroviridae
	Incertae sedis	Incertae sedis	Incertae sedis	Incertae sedis	Polymycoviridae, Sarthroviridae
Varidnaviria	Bamfordvirae	Nucleocytoviricota	Megaviricetes	Algavirales	Phycodnaviridae
				Imitervirales	Mimiviridae
				Pimascovirales	Ascoviridae, Iridoviridae, Marseilleviridae
			Pokkesviricetes	Asfuvirales	Asfarviridae
			Pokkesviricetes	Chitovirales	Poxviridae
		Preplasmiviricota	Maveriviricetes	Priklausovirales	Lavidaviridae
			Tectiliviricetes	Belfryvirales	Turriviridae
				Kalamavirales	Tectiviridae
				Rowavirales	Adenoviridae
				Vinavirales	Corticoviridae
	Helvetiavirae	Dividoviricota	Laserviricetes	Halopanivirales	Sphaerolipoviridae
Incertae sedis	Incertae sedis	Incertae sedis	Incertae sedis	Ligamenvirales	Lipothrixviridae, Rudiviridae
Incertae sedis	Incertae sedis	Incertae sedis	Incertae sedis	Incertae sedis	Alphasatellitidae, Ampullaviridae, Anelloviridae, Avsunviroidae, Baculoviridae, Bicaudaviridae, Clavaviridae, Finnlakeviridae, Fuselloviridae, Globuloviridae, Guttaviridae, Halspiviridae, Hytrosaviridae, Nimaviridae, Nudiviridae, Ovaliviridae, Plasmaviridae, Polydnaviridae, Portogloboviridae, Pospiviroidae, Spiraviridae, Thaspiviridae, Tolecusatellitidae, Tristromaviridae

Klasifikasi Baltimore

Sistem pengelompokan virus ini diajukan oleh David Baltimore, seorang ilmuwan asal Amerika Serikat. Ia membagi virus menjadi tujuh kategori berdasarkan jenis genom (DNA atau RNA) dan metode replikasinya.^[3]

Kelas I: DNA utas ganda
Kelas II: DNA utas tunggal
Kelas III: RNA utas ganda
Kelas IV: RNA utas tunggal (+)
Kelas V: RNA utas tunggal (-)
Kelas VI: RNA utas tunggal (+) dengan DNA Intermediat
Kelas VII: DNA utas ganda dengan RNA Intermediat

Referensi

^ ICTV (2018a). "ICTV Code: The International Code of Virus Classification and Nomenclature October 2018". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 16 Agustus 2019.
^ "Virus Taxonomy: 2019 Release". ICTV Online. Juli 2019. Diakses tanggal 7 Oktober 2020.
^ Baltimore D (1971). "Expression of animal virus genomes". Bacteriol Rev. 35 (3): 235–41. PMC 378387. PMID 4329869.

Pranala luar

ICTV Diarsipkan 2017-02-03 di Wayback Machine.
Master Species Lists Diarsipkan 2016-03-05 di Wayback Machine. pada situs web International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)

[1] ICTV (2018a). "ICTV Code: The International Code of Virus Classification and Nomenclature October 2018". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 16 Agustus 2019.

[2] "Virus Taxonomy: 2019 Release". ICTV Online. Juli 2019. Diakses tanggal 7 Oktober 2020.

[pmid4329869-3] Baltimore D (1971). "Expression of animal virus genomes". Bacteriol Rev. 35 (3): 235–41. PMC 378387. PMID 4329869.

[1]

[2]

[3]