Kromosom 1
Kromosom 1 | |
---|---|
![]() Pasangan kromosom 1 manusia setelah pemitaan G. Satu dari ibu, dan satu dari ayah. | |
![]() Pasangan kromosom 1 dalam kariogram manusia laki-laki | |
Ciri | |
Panjang (bp) | 248,387,328 bp (CHM13) |
No. gen | 1,961 (CCDS)[1] |
Jenis | Autosom |
Posisi sentromer | Metasentris[2] (123.4 Mbp[3]) |
Daftar gen lengkap | |
CCDS | Daftar gen |
HGNC | Daftar gen |
UniProt | Daftar gen |
NCBI | Daftar gen |
Penampil peta eksternal | |
Ensembl | Chromosome 1 |
Entrez | Chromosome 1 |
NCBI | Chromosome 1 |
UCSC | Chromosome 1 |
Urutan DNA lengkap | |
RefSeq | NC_000001 (FASTA) |
GenBank | CM000663 (FASTA) |
Kromosom 1 adalah nama yang diberikan untuk kromosom manusia terbesar. Manusia memiliki dua salinan kromosom 1, seperti pada autosom lainnya, yang mencakup semua kromosom yang bukan kromosom penentu jantina. Kromosom 1 memiliki 249 juta pasangan basa nukleotida, yang merupakan satuan-satuan dasar informasi untuk DNA.[4] Kromosom ini mewakili sekitar 8% dari total DNA pada sel-sel manusia.[5]
Kromosom ini menjadi kromosom terakhir yang selesai diurut pada Proyek Genom Manusia.
Jumlah gen
Berikut adalah estimasi jumlah gen untuk kromosom manusia 1. Karena ahli-ahli menggunakan pendekatan-pendekatan yang berbeda untuk menganotasikan genom, perkiraan-perkiraan jumlah gen pada setiap kromosom berbeda. Di antara proyek-proyek lainnya, Proyek Pengurutan Koding Konsensus Kolaboratif (CCDS) menggunakan sebuah strategi yang sangat konservatif. Oleh karena itu, prediksi jumlah gen oleh CCDS mewakili batas ambang bawah untuk jumlah total gen-gen penyandi-protein manusia.[6]
Diperkirakan oleh | Gen penyandi protein | Gen RNA non-penyandi | Pseudogen | Sumber | Tanggal terbit |
---|---|---|---|---|---|
CCDS | 1,961 | — | — | [1] | 2016-09-08 |
HGNC | 1,993 | 707 | 1,113 | [7] | 2017-05-12 |
Ensembl | 2,044 | 1,924 | 1,223 | [8] | 2017-03-29 |
UniProt | 2,064 | — | — | [9] | 2018-02-28 |
NCBI | 2,093 | 1,790 | 1,426 | [10][11][12] | 2017-05-19 |
Referensi
- ^ a b "Search results - 1[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. CCDS Release 20 for Homo sapiens. 2016-09-08. Diakses tanggal 2017-05-28.
- ^ name="StrachanRead2010">Tom Strachan; Andrew Read (2 April 2010). Human Molecular Genetics. Garland Science. hlm. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
- ^ Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-06-03. Retrieved 2017-04-26.
- ^ http://vega.sanger.ac.uk/Homo_sapiens/mapview?chr=1 Chromosome size and number of genes derived from this database, retrieved 2012-03-11.
- ^ Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, Kaul R, Swarbreck D, Dunham A, et al. (May 2006). "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1". Nature. 441 (7091): 315–21. Bibcode:2006Natur.441..315G. doi:10.1038/nature04727. PMID 16710414.
- ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). "Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes". Genome Biol. 11 (5): 206. doi:10.1186/gb-2010-11-5-206. PMC 2898077. PMID 20441615.
- ^ "Statistics & Downloads for chromosome 1". HUGO Gene Nomenclature Committee. 2017-05-12. Diarsipkan dari asli tanggal 2017-06-29. Diakses tanggal 2017-05-19.
- ^ "Chromosome 1: Chromosome summary - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 2017-03-29. Diakses tanggal 2017-05-19.
- ^ "Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM". UniProt. 2018-02-28. Diakses tanggal 2018-03-16.
- ^ "Search results - 1[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.
- ^ "Search results - 1[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.
- ^ "Search results - 1[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype pseudo"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.